A UFGD atualmente tem 18 cursos de mestrado e 8 cursos de doutorado. No mês de outubro abrem inscrições para o processo de seleção de candidatos para formar as turmas de 2015 para a maioria desses cursos.
O processo de seleção varia de acordo com o programa de pós-graduação. Geralmente, é formado por uma prova escrita, uma prova de proficiência em língua estrangeira, análise de currículo Lattes e apreciação do projeto de pesquisa. Contudo, cada curso pode incluir outras formas de avaliação, de acordo com o edital de seleção de candidatos. Nos editais constam dados sobre datas de inscrição, linhas de pesquisa, etapas de seleção, documentos necessários para inscrição e prazo para matrícula.
Já foram divulgados os editais de seleção de candidatos para os mestrados em Química, em Agronegócios, em Biologia/Bioprospecção e em Sociologia. Também já foram divulgados os editais dos programas de pós-graduação em Entomologia e Conservação da Biodiversidade e em História, que oferecem vagas em mestrado e doutorado. Todos abrem as inscrições em outubro.